В основі структури Міністерства внутрішніх справ – Державний департамент автомобільної інспекції, Департамент роботи з персоналом, Департамент медичного забезпечення та реабілітації, Департамент ресурсного забезпечення МВС України.

До складу структурних підрозділів Центрального апарату МВС України належать: Національне Центральне Бюро Інтерполу в Україні, Головне управління внутрішніх військ МВС, Головне управління по боротьбі з організованою злочинністю, Державний науково-дослідний експертно-криміналістичний центр, Центр громадських зв'язків МВС України.

Структура станом на 17.09.2008

1.Керівництво
2. Апарат Міністра

2.1  Управління моніторингу дотримання прав людини в діяльності ОВС
3. Радники МВС України
4. (ГУБОЗ) Головне управління по боротьбі з організованою злочинністю
4.1. (СВБ) Служба внутрішньої безпеки ГУБОЗ  (на правах управління)

5. Кримінальна міліція
5.1. (ДКР) Департамент карного розшуку
5.2. (ДДСБЕЗ) Департамент Державної служби боротьби з економічною злочинністю
5.3. (ДБНОН) Департамент боротьби з незаконним обігом наркотиків
5.4. (ДБЗПТЛ) Департамент боротьби зі злочинами, пов’язаними з торгівлею людьми
5.5. (ДКМСД) Департамент кримінальної міліції у справах дітей
5.6. (ДОС) Департамент оперативної служби 
5.7. (ДОТЗ) Департамент оперативно-технічних заходів

5.8    (УСО) Управління спеціальних операцій

5.9   (КС) Кінологічна служба (на правах відділу)
6.  (РА УБ Інтерполу) Робочий апарат Укрбюро Інтерполу (на правах департаменту)
7. Міліція громадської безпеки
7.1. (ДГБ) Департамент громадської безпеки
7.2. (ДДАІ) Департамент Державної автомобільної інспекції
7.3. (УВМПКВЗ) Управління ветеринарної міліції з проведення карантинних ветеринарних заходів 
8. (ДДСО) Департамент Державної служби охорони (функціонує при Міністерстві)
9. (ГУВВ) Головне управління внутрішніх військ
10. (ГСУ) Головне слідче управління
11. (УД) Управління дізнання
12. (ГШ) Головний штаб (на правах департаменту)

13. (ДКЗ) Департамент кадрового забезпечення

14. (ДОН) Департамент освіти та науки 
15. (ДЗГМД) Департамент зв'язків із громадськістю та міжнародної діяльності

16. (ДДЗР) Департамент документального забезпечення та режиму
17. (ДІТ) Департамент інформаційних технологій

18. (ДФЗБО) Департамент фінансового забезпечення та бухгалтерського обліку
19. (ДРЗ) Департамент ресурсного забезпечення

20. (ДМЗР) Департамент медичного забезпечення та реабілітації

21. (ДЗ) Департамент зв’язку

22. (УЮЗ) Управління юридичного забезпечення

23. (УВВРУКМУ) Управління взаємодії з Верховною Радою України, Кабінетом Міністрів України, іншими органами виконавчої влади та органами місцевого самоврядування

24. (КРУ) Контрольно-ревізійне управління
26. (ГУ) Господарське управління

27. (УКБІ) Управління капітального будівництва та інвестицій

28. (ВДНОП) Відділ державного нагляду за охороною праці
29. (СПБ) Служба пожежної безпеки (на правах відділу)

Підпорядковані МВС

(ДНДЕКЦ) Державний науково-дослідний експертно-криміналістичний центр
(ДНДІ) Державний науково-дослідний інститут

Вищі навчальні заклади МВС України

Урядові органи державного управління

(ДДГІРФО) Державний департамент у справах громадянства, імміграції та реєстрації фізичних осіб

Територіальні підрозділи МВС України у областях